Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm21244J3QK38 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm21244J3QK38 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms