Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms