Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vmn1r34G3XA52 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r34G3XA52 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r34G3XA52 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r34G3XA52 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r34G3XA52 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vmn1r34G3XA52 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r34G3XA52 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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