Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm16519F8VQK7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms