Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
BC067074F6RXI4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
BC067074F6RXI4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms