Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms