Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fndc1E9Q043 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fndc1E9Q043 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms