Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc6D3YZP9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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