Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Samd1D3YXK1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms