Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms