Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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