Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Prr16A3KMN5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Prr16A3KMN5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Prr16A3KMN5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr16A3KMN5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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