Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp8b5A3FIN4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atp8b5A3FIN4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms