Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Scn3aA2ASI5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scn3aA2ASI5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn3aA2ASI5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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