Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Rtf1A2AQ19 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Rtf1A2AQ19 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtf1A2AQ19 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms