Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd1A2AKB4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd1A2AKB4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms