Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pramel3A2AHA7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramel3A2AHA7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms