Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Cldn34dA2AGU5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms