Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap5A2AGT5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms