Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms