Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pramef6A2A8M8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms