Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itgb4A2A863 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itgb4A2A863 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms