Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc194A0A140LIT1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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