Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrit3W8DXL4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrit3W8DXL4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrit3W8DXL4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms