Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rps6ka4Q9Z2B9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka4Q9Z2B9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms