Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lgr5Q9Z1P4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lgr5Q9Z1P4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgr5Q9Z1P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms