Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx39bQ9Z1N5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx39bQ9Z1N5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddx39bQ9Z1N5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms