Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setbp1Q9Z180 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Setbp1Q9Z180 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Setbp1Q9Z180 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Setbp1Q9Z180 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Setbp1Q9Z180 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Setbp1Q9Z180 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Setbp1Q9Z180 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Setbp1Q9Z180 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms