Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn3Q9WUK7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn3Q9WUK7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms