Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zeb2Q9R0G7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb2Q9R0G7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms