Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtsfQ9R013 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtsfQ9R013 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms