Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr4a3Q9QZB6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr4a3Q9QZB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms