Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Six6Q9QZ28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Six6Q9QZ28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms