Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca3a1Q9QX15 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Clca3a1Q9QX15 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms