Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mid2Q9QUS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mid2Q9QUS6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms