Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc4Q9QUQ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc4Q9QUQ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc4Q9QUQ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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