Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AtrQ9JKK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AtrQ9JKK8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AtrQ9JKK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms