Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smad9Q9JIW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smad9Q9JIW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smad9Q9JIW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms