Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r3fQ9JIG4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ppp1r3fQ9JIG4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ppp1r3fQ9JIG4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ppp1r3fQ9JIG4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms