Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenofQ9ERR7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelenofQ9ERR7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenofQ9ERR7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms