Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Scn4aQ9ER60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Scn4aQ9ER60 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Scn4aQ9ER60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Scn4aQ9ER60 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Scn4aQ9ER60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms