Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tlr9Q9EQU3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr9Q9EQU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms