Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms