Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4Q9DAW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf4Q9DAW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf4Q9DAW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms