Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc54Q9DAL3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc54Q9DAL3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms