Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldnd2Q9D9H2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldnd2Q9D9H2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms