Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D8Q6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8Q6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8Q6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms