Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13Q9D777 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnfsf13Q9D777 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnfsf13Q9D777 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms