Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc83Q9D4V3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc83Q9D4V3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc83Q9D4V3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms