Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Clvs1Q9D4C9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clvs1Q9D4C9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clvs1Q9D4C9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms